《萌菌物语》真人版以石川雅之同名漫画为蓝本，聚焦于拥有“看见细菌”特异功能的少年泽木惣右卫门直保。他进入东京农业大学后，与青梅竹马结城萤以及个性鲜明的同学们，在校园里展开了一段段啼笑皆非的日常。直保的能力既带来便利，也惹来麻烦，比如能直观发现发酵过程中的菌群状态，却也因此被卷入各种实验与事件中。

剧集在搞笑与温情间平衡，生动刻画了农业大学学生的校园生活，从酿造、发酵到微生物研究，处处渗透着专业细节。每个角色都充满活力，而拟人化的细菌形象更是萌点十足，让观众在欢笑中了解乳酸菌、酵母、霉菌等微生物的习性。故事不仅展现青春友情与成长，也传递了“微小生命也值得敬畏”的理念。

全剧节奏明快，科普元素自然融入剧情，既不生硬也不说教，适合对生物或农业感兴趣的观众，也适合喜爱轻松校园喜剧的人群。通过直保的视角，观众得以窥见一个肉眼不可见却生机勃勃的微观世界，体验科学与生活碰撞出的奇妙火花。