《宝可梦：超梦的逆袭 进化》是经典剧场版《超梦的逆袭》的3D重制版，故事围绕科学家利用梦幻的基因制造出最强宝可梦超梦展开。超梦诞生后，因无法接受自己是被创造出来的复制品，内心充满困惑与愤怒，最终逃出实验室，向人类宣战。

为了证明自身的存在价值，超梦邀请各地训练家携带宝可梦前来，在孤岛上展开一场残酷的克隆宝可梦与原版宝可梦的对决。小智、小霞和小刚也受邀前往，却发现这场战斗并非简单的胜负之争，而是关乎生命尊严与自由意志的考验。

当克隆宝可梦与原版宝可梦陷入混战，小智毅然挡在双方之间，以血肉之躯承受攻击，他的勇敢与善良唤醒了超梦内心深处的良知。最终，超梦理解了生命的平等与珍贵，与克隆宝可梦们一同离开，去寻找属于自己的未来。影片以华丽的3D视觉重塑经典，深刻探讨了“我是谁”与“生命的意义”等哲学命题，感动了无数观众。