故事发生在1963年的横滨，一个充满复苏气息的港口小镇。松崎家四姐弟与寄宿的房客共同生活，长女松崎海每天清晨都会升起一面信号旗，寄托对远航父亲的思念。她性格坚强，照料着全家的起居，同时兼顾学业。

某天，海与同校新闻部的少年风间俊相遇。俊因参与学生运动而备受关注，两人在保护即将被拆除的旧社团大楼“拉丁区”时逐渐走近。拉丁区是学生们的精神角落，藏满旧书、画作与回忆，他们为守护它而奔走，也在此过程中发现了彼此身世中隐秘的牵连——原来，海与俊可能是同父异母的兄妹。

面对突如其来的真相，两人陷入情感与伦理的挣扎。而随着调查深入，他们发现父辈当年的故事远比想象中复杂。最终，在港口祭典的灯火与海风中，两人以坦诚与勇气化解心结，拥抱属于他们的青春与未来。影片以细腻的笔触描绘了战后一代的成长、家庭羁绊与时代变迁，宫崎吾郎的执导与吉卜力一贯的唯美画风，让这段昭和物语温暖而动人。