宇宙世纪0079年，地球联邦与吉翁公国间的“一年战争”已进入相持阶段。白色要塞队一路转战，少年阿姆罗·雷凭借新人类资质驾驶RX-78-2高达屡建战功，成为联邦军瞩目的王牌机师。然而，战场上的每一次胜利都伴随着同伴的牺牲与敌人的陨落，阿姆罗在杀戮与失去中逐渐感受到强烈的痛苦与孤独。

本片作为剧场版三部曲的第二部，以TV动画第13至31集内容重新剪辑构成，聚焦于“哀”的主题。阿姆罗与青梅竹马芙劳·波之间若即若离的情感，与宿敌夏亚·阿兹纳布尔的数次交锋，以及白色要塞内战友们相继阵亡的悲怆，共同交织成一道沉重的人性拷问。同时，联邦军新人类部队“木马队”的登场，以及拉拉·辛等角色的出现，进一步揭示了新人类在战争中的悲剧性命运。

影片在保留原作经典机战场面的基础上，强化了人物内心戏的刻画，以更精炼的叙事节奏呈现战争对少年灵魂的侵蚀。高达不再是单纯的兵器，而成为承载哀伤与责任的符号。最终，阿姆罗在硝烟中继续前行，但那份无法抹去的哀伤，已深深刻入他的灵魂，为第三部《相逢在宇宙》的终局埋下伏笔。