故事发生在宇宙世纪0083年，一年战争结束后的第三年。联邦军为重建战力而推进“高达开发计划”，在澳大利亚的托林顿基地对两台试作机——象征泛用格斗战的GP01“玉帘”与搭载核弹的重装型GP02A“酸浆果”进行测试。

然而，前吉翁公国残党“迪拉兹舰队”突然发动奇袭，王牌机师阿纳贝尔·卡多驾驶GP02A强行夺取核弹后逃脱。代号“星尘作战”的庞大阴谋就此启动。联邦军年轻测试驾驶员浦木宏，在混乱中被迫登上GP01，与卡多展开跨越宇宙与地球的激烈追逐。

随着追踪深入，宏逐渐发现“星尘作战”的真正目标——利用核弹与殖民卫星坠落，向联邦军发动致命一击，试图重演一年战争的悲剧。在友情、爱情与战火交织中，宏与宿敌卡多的对决，不仅关乎个人荣辱，更牵动地球圈的命运。最终，星尘的轨迹坠落，留下的是对战争与人性的深刻反思。